Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vdac3Q60931 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vdac3Q60931 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms