Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms