Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf4Q60793 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms