Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2dQ60773 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2dQ60773 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms