Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stxbp3Q60770 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stxbp3Q60770 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms