Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Epha1Q60750 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms