Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samhd1Q60710 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samhd1Q60710 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms