Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmelQ60696 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PmelQ60696 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PmelQ60696 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PmelQ60696 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PmelQ60696 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms