Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms