Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr1h2Q60644 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms