Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prdm1Q60636 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms