Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Utp20Q5XG71 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Utp20Q5XG71 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms