Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc42Q5SV66 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms