Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme4Q5SSW2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme4Q5SSW2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms