Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms