Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim41Q5NCC3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim41Q5NCC3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.7 ms