Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1810065E05RikQ5NC41 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
1810065E05RikQ5NC41 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms