Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttf2Q5NC05 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms