Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vps41Q5KU39 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms