Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf3Q5HZG4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf3Q5HZG4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms