Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc3Q5DU56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrc3Q5DU56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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