Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc8bQ5DU41 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms