Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp22Q5DU02 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp22Q5DU02 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp22Q5DU02 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp22Q5DU02 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp22Q5DU02 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms