Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prune2Q52KR3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prune2Q52KR3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms