Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a5Q4LDG0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc27a5Q4LDG0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc27a5Q4LDG0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc27a5Q4LDG0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc27a5Q4LDG0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc27a5Q4LDG0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc27a5Q4LDG0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc27a5Q4LDG0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a5Q4LDG0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms