Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim26Q3V460 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms