Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pydc3Q3V3Q4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pydc3Q3V3Q4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms