Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Esf1Q3V1V3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Esf1Q3V1V3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Esf1Q3V1V3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms