Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ccdc185Q3V118 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ccdc185Q3V118 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Ccdc185Q3V118 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ccdc185Q3V118 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc185Q3V118 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc185Q3V118 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc185Q3V118 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc185Q3V118 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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