Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms