Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hipk4Q3V016 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms