Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prdm6Q3UZD5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm6Q3UZD5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms