Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnpc3Q3UZ01 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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