Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc160Q3UYG1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms