Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms