Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbm20Q3UQS8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbm20Q3UQS8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms