Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5460Q3UQ97 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5460Q3UQ97 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5460Q3UQ97 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms