Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc4Q3UP44 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nhlrc4Q3UP44 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms