Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nlrc4Q3UP24 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlrc4Q3UP24 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms