Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cobll1Q3UMF0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cobll1Q3UMF0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms