Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc33Q3ULW6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc33Q3ULW6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms