Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smu1Q3UKJ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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