Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp19Q3UJD6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp19Q3UJD6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms