Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Yipf3Q3UDR8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms