Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U6N9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U6N9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms