Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl21Q3U410 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl21Q3U410 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms