Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pag1Q3U1F9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms