Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc174Q3U155 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc174Q3U155 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms