Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem35bQ3U0Y2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem35bQ3U0Y2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms