Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a5Q3TYU2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms